Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Gtpbp6Q3U6U5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Gtpbp6Q3U6U5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Gtpbp6Q3U6U5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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Gtpbp6Q3U6U5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Gtpbp6Q3U6U5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Gtpbp6Q3U6U5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Gtpbp6Q3U6U5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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