Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q3U6N9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q3U6N9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q3U6N9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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