Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms