Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms