Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms