Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3TTL0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3TTL0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTL0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms