Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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