Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms