Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem248Q3TBN1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms