Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms