Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms