Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vax1Q2NKI2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vax1Q2NKI2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms