Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms