Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms