Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms