Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NeblQ0II04 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms