Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms