Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms