Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms