Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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