Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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