Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms