Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms