Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlh1Q02576 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms