Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms