Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms