Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms