Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms