Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms