Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlkP97793 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlkP97793 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
AlkP97793 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AlkP97793 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AlkP97793 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlkP97793 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlkP97793 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms