Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms