Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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