Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms