Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms