Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Acta1P68134 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms