Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UbdP63072 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UbdP63072 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UbdP63072 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UbdP63072 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbdP63072 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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UbdP63072 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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UbdP63072 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbdP63072 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbdP63072 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbdP63072 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms