Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms