Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab3cP62823 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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