Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga11P61622 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms