Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Depdc5P61460 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms