Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms