Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf2P59222 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms