Protein–RNA interactions for Protein: P58871

Tnks1bp1, 182 kDa tankyrase-1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnks1bp1P58871 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnks1bp1P58871 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnks1bp1P58871 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnks1bp1P58871 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnks1bp1P58871 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnks1bp1P58871 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnks1bp1P58871 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms