Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms