Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms