Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms