Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms