Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndst2P52850 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndst2P52850 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms