Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp1P52624 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms