Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms